王禹偁被召还京不久，又因“讪谤”之罪，出知滁州（今安徽滁县，后来欧阳修在此构筑了他“醉翁的世界”）。这时他深感“报国惟直道”，是难以在官场立足的。“四年两度黜”“销尽百炼钢”，滋生了“何当解组绶，归田谢膏梁。教儿勤稼穑，与妻甘糟糠”的念头。真宗嗣位后，诏求直言。不甘寂寞的王禹偁又上疏陈奏五条政见，指出“冗吏耗于上，冗兵耗于下，此所以尽取山泽之利而不能足也”，提议：一、谨边防，通盟好，使辇运之民，有所休息；二，减冗兵，并冗吏，使山泽之利，稍流于下；三、艰难选举，使人官不滥；四、沙汰僧尼，使疲民无耗；五、亲大臣，远小人。这些意见，可说是几十年后范仲淹改革主张的先声。奏疏上达后，他被召回，但又受到宰相的排挤，出知黄州（今湖北黄冈，苏东坡步其后尘的贬所）。他悲愤异常，离京时向当权者发出“未甘便葬江鱼腹，敢向台阶请罪名”的质询。
在黄州，王禹偁以诗酒琴棋消忧解愤，最著名的散文是《黄州新建小竹楼记》，以寓居竹楼所领略到的风光与情趣，与上层统治者的奢华生活对比。小楼二间“夏宜急雨，有瀑布声；冬宜密雪，有碎玉声；宜鼓琴，琴调虚畅；宜咏诗，诗韵清绝；宜围棋，子声丁丁然；宜投壶，矢声铮铮然”，而“公退之暇，披鹤氅，戴华阳巾，手执《周易》一卷，焚香默坐，消遣世虑，江山之外，第见风帆沙鸟烟云竹树而已。待其酒力醒，茶烟歇，送夕阳，迎素月，亦谪居之胜概也”。而那些崇楼华阁，“止于贮妓女，藏歌舞，非骚人之事，吾所不取！”在黄州住了两年多，王禹偁又奉命移任蕲州（今湖北蕲春），到郡未逾月而病逝，年仅四十八岁。谏议大夫戚纶为其作诔文，有“事上不曲邪，居下不谄佞，见善若己有，嫉恶过仇雠”之句，世以为知言。
王禹偁是有政治抱负的士人，很想根据儒家一套理想化的秩序模式，干一番事业：“吾生非不辰，吾志复不卑”“致君望尧舜”。然而，因循现状的政局和忌忠直、喜谗谀的官场，却使他的主观愿望多次碰壁。尽管他表示：“屈于身兮不屈其道，任百谪而何亏”（《三黜赋》），毕竟壮志未酬，郁郁谢世。但这种遭际，又使他成为北宋诗文改革的前驱。他自己也相信：“贫久心还乐，吟多骨亦清。他年文苑传，应不漏吾名。”（《览照》）又说：“本与乐天为后进，敢期子美是前身”，对杜甫、白居易十分推崇。其诗作既反映民瘼，又有可贵的自责精神。“胡为碌碌事文笔，歌时颂圣如俳优！”又如：“吾族不力穑，终岁饱且温，虽非享富贵，亦已蠹黎元。”他的一些景物诗，往往有感而发：“平生结句多山水，谪官谁知是胜游”“石挨苦竹旁抽笋，雨打戎葵卧放花”，表现了一种不屈不挠的精神状态。
